有默认的线权重,并且默认是无向线的,directed=T时就代表有向线。
5、传播标签社群发现

#社群发现方法五:标签传播社群发现??
member<-label.propagation.community(g.undir,weights=V(g.undir)$weight)??
V(g.undir)$member??
member<-label.propagation.community(g.undir,weights?=?E(g.undir)$weight,initial?=?c(1,-1,1))??
V(g.undir)$member??
member<-label.propagation.community(g.undir,??
????????????????????????????????????initial?=?c(1,1),fixed=c(T,F,T))??
initial是社群初始化函数,默认为-1(不设置初始值),当然这里你也可以设置;如initial=c(1,2)就代表1,2个数为社群1;3、4不设置初始值;5个为社群2 fixed是用来固定函数的,当然如果没有设定初始值,如3.4.6则T,F都无效;如果设定了初始值,T则代表固定在原设定上。
二、衡量社群的指标
1、模块化指标Q——modularity
相当于是组内误差。
modularity(g.undir,membership=c(1,2))??#社群总差异,membership设置社群号??
membership是每个点的各自分组情况。

2、网络聚类系数——transitivity
是表示一个图形中节点聚集程度的系数,一个网络一个值。
3、网络密度——graph.density
跟网路聚类系数差不多,也是用来形容网络的结构复杂程度。越大,说明网络越复杂,说明网络越能够放在一块。
graph.density(g.zn)??
graph.density(group1)??
graph.density(group2)??
#从中可以看到不同社群与整体之间的网络密度情况(关联程度)??
三、画 图
由于关系网络图很复杂,而且数据量一大,小的图片形式网路图基本就是一坨浆糊。所以这里JPEG一定要足够大,最好的就是SVG格式。SVG格式的好处就是矢量图,你可以自己放大缩小,而且还可以用工具进行修改。但是最不好就是,一般的工具还打开不了,要用一些特有的工具,打开之后也会出现一些问题。
当然你是可以直接plot的。
1、直接plot
plot(g.test,layout=layout.fruchterman.reingold,edge.arrow.size=0.1,vertex.color=rainbow(7,alpha=0.3),edge.arrow.mode?=?"-")??
代码解读:edge.arrow.size=0.1箭头大小;
vertex.color=rainbow(7,alpha=0.3)颜色,七种;
edge.arrow.mode = "-"连接方式用-。
其中还有很多参数类型:
#vertex.size=1表示节点的大小??
#layout表示布局方式(发散性)??
#vertex.label=NA,不显示任何点信息,默认显示idx号??
#vertex.color=V(g)$color?点的颜色设置??
#mark.groups表示设置分组??
#vertex.shape='none'不带边框???
#vertex.label.cex=1.5,?#节点字体大小??
#vertex.label.color='red'??
#edge.arrow.size=0.7?#连线的箭头的大小??
#edge.color?=?grey(0.5)#线的颜色??
#edge.arrow.mode?=?"-"?箭头换成线??
#vertex.label.dist=5??点标签和节点之间的距离一般0.1,便于错开重叠??
2、简易画图自编译函数
R语言与网站分析中还专门写了一个画图函数。
plot.membership<-function(graph,membership,main=""){??
??V(graph)$member<-membership??
??mem.col<-rainbow(length(unique(membership)),alpha=0.3)??
??V(graph)$color<-mem.col[membership]??
??plot(graph,edge.width=E(graph)$weight,vertex.color=V(graph)$color,main=main)??
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(编辑:滨州站长网)
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